
傳統(tǒng)上,病毒以它們首次發(fā)現(xiàn)的地點或動物來命名?,F(xiàn)在,科學(xué)家們正試圖給病毒命名的混亂帶來秩序。登革熱是一種有其他名稱的病毒,為什么科學(xué)家要重新命名病毒?
在16世紀(jì)的最后幾十年,醫(yī)生開始報告世界各地爆發(fā)了一種新的傳染病。在費城、波多黎各、爪哇和開羅,人們正在經(jīng)歷一種以發(fā)燒和劇烈疼痛為特征的疾病遍布整個身體,他們稱之為“斷骨熱”(或拉丁美洲的“quebrantaHuesos”)。
大約30年后,即1801年,馬德里爆發(fā)了一場疫情,當(dāng)時的西班牙女王瑪麗亞·路易莎·德·帕爾馬(MaríaLuisadeParma)也感染了這種疾病。在她康復(fù)后寫的一封信中,女王描述了她的一些癥狀,并用我們今天更熟悉的名字來稱呼這種疾病——登革熱。
“我感覺好多了,因為時尚界的寒冷,他們稱之為登革熱,”她寫道。“從昨天開始,我就流了一些血,這讓我很不舒服,說話一段時間后,喉嚨就痛。”
現(xiàn)在我們知道登革熱是由四種密切相關(guān)的病毒屬于黃病毒組。它們通過特定種類的蚊子傳播,埃及人的神廟和白紋伊蚊在世界熱帶和亞熱帶地區(qū).任何地方都可能發(fā)生疫情這些昆蟲是自然發(fā)現(xiàn)的并且會影響很多人。2024年前四個月,超過760萬登革熱病例,并向世界衛(wèi)生組織(WHO)報告了3,000人死亡,超過了2023年全年報告病例650萬例。到2024年7月開始,世界衛(wèi)生組織全球登革熱監(jiān)測系統(tǒng)全球報告了960萬例病例(有記錄以來的最高發(fā)病率)和5,366例死亡。2023年,世界衛(wèi)生組織收到報告稱,有7,300人死于登革熱。
近五年來該病發(fā)病率迅速上升氣候變化和厄爾尼諾氣候模式帶來更溫暖、更濕潤的環(huán)境,使攜帶病毒的昆蟲得以生存?zhèn)鞑サ叫碌念I(lǐng)域并擴大了疾病的傳播。
該病毒被發(fā)現(xiàn)是在90個國家積極傳播2024年,與31個國家報告的病例數(shù)高于平常。美洲的病例增幅最大,美國疾病控制與預(yù)防中心(CDC)于2024年6月發(fā)布了有關(guān)該病例的健康警報美國登革熱病毒感染風(fēng)險增加。
但登革熱如何得名的故事讓我們深入了解病毒命名的有趣且往往相當(dāng)隨機的世界。許多病毒因其癥狀而得名,而另一些病毒則因癥狀而得名。以地點命名和甚至動物其他詞的詞源已經(jīng)消失在時間的迷霧中。由于強大的分析技術(shù)使其更容易識別病毒,已知的列表病毒正在迅速增長。作為回應(yīng),科學(xué)家們正試圖從混亂中建立一些秩序,開發(fā)系統(tǒng)命名系統(tǒng)這使得在新病毒出現(xiàn)時更容易對其進行識別和分類。
目前有14,690種已知病毒已被正式分類,但科學(xué)家們并不清楚世界上存在多少種不同的病毒。例如,據(jù)估計,僅哺乳動物就攜帶320,000種病毒,而最近另一項關(guān)于人類腸道的研究發(fā)現(xiàn)140,000個噬菌體–一種感染細(xì)菌細(xì)胞的病毒。
大約已知有270種病毒可感染人類但隨著由Sars-CoV-2、寨卡病毒和Mpox等病毒引起的新傳染病的出現(xiàn),這個名單也在不斷增加。
登革熱這個名字的確切起源有點不確定,但它與癥狀有關(guān)。感染者感覺他們的骨骼和肌肉正在僵硬,這使得運動變得痛苦和尷尬。一種理論認(rèn)為登革熱可能源自該疾病的斯瓦希里語術(shù)語的西班牙語版本,基登加惡魔,這意味著突然被邪靈追上?;蛘?,它可能來自人們的方式在加勒比地區(qū)發(fā)音為“dandy”,該疾病最常見的地方,或西班牙語的對應(yīng)詞“聽”,參考患有這種疾病的人步態(tài)僵硬、不協(xié)調(diào).
后者似乎是描述一種相當(dāng)令人討厭的疾病的一種有點快活的方式。
登革熱病毒屬于一組稱為出血熱病毒。許多是通過蚊子叮咬傳播的,一些是通過蜱蟲傳播的,還有一些可以通過蝙蝠等其他哺乳動物傳播給人類,還有一些甚至可以通過直接接觸血液和體液在人與人之間傳播。它們都會引起發(fā)燒、劇烈頭痛、關(guān)節(jié)和肌肉疼痛、腹瀉和嘔吐以及身體各處出血和瘀傷等癥狀。并非每個人都會出現(xiàn)明顯的癥狀,但病毒性出血熱可能非常嚴(yán)重。他們包括埃博拉病毒,尼帕和馬爾堡病毒,死亡率很高,而且是非常令人不愉快的疾病。
然而,病毒性出血熱(VHF)的得名卻很有趣。有些來自對癥狀的描述,例如登革熱。
還有另一種蚊媒病毒性出血熱,會影響肝臟并導(dǎo)致患者出現(xiàn)黃疸。人們決定將其稱為黃熱病并不完全令人驚訝。然而,這給我們帶來了一個使用癥狀作為病毒名稱基礎(chǔ)的問題——其他感染通常也有類似的癥狀。
許多肝臟感染可導(dǎo)致黃疸,即眼白、尿液和偶爾皮膚發(fā)黃。這甲型、乙型、丙型、丁型和戊型肝炎病毒就是很好的例子,但Epstein-Barr病毒會引起腺熱,并以發(fā)現(xiàn)它的兩位科學(xué)家的名字命名-病理學(xué)家邁克爾·愛潑斯坦和病毒學(xué)家伊馮·巴爾–還會造成肝臟損傷這可能會導(dǎo)致黃疸。風(fēng)疹病毒,導(dǎo)致德國麻疹,是另一個基于癥狀的名稱源自拉丁語“小紅”它在患者身上引起皮疹后,也被發(fā)現(xiàn)會導(dǎo)致極少數(shù)情況下會出現(xiàn)肝臟問題,特別在新生兒中.
有些病毒甚至以兩個相距數(shù)千英里的不同地點命名
即使是一些命名更有趣的病毒也可以通過它們的名稱追溯到它們引起的癥狀的描述。基孔肯雅熱——一種使人衰弱的蚊媒病毒,會導(dǎo)致發(fā)燒和嚴(yán)重的關(guān)節(jié)疼痛——可以翻譯為“彎曲的東西”源自東非坦桑尼亞地區(qū)的當(dāng)?shù)卣Z言Kimakonde,該地區(qū)是該疾病首次被發(fā)現(xiàn)的地方。其名稱指的是痛苦的姿勢許多感染該病毒的患者都采用了這種方法。另一種導(dǎo)致基孔肯雅熱癥狀幾乎無法區(qū)分的相關(guān)病毒是奧尼永尼永,從烏干達北部的阿喬利方言翻譯為“關(guān)節(jié)變?nèi)醴浅M纯?rdquo;.
然后是病毒,表示病毒首次發(fā)現(xiàn)的地點。這與玻利維亞出血熱有關(guān)的病毒例如,它被稱為馬丘波病毒(MachupoVirus),得名于玻利維亞圣華金(SanJoaquin)的一條河流,靠近1959年首次爆發(fā)的地方。
但有些病毒甚至發(fā)現(xiàn)自己以兩個相距數(shù)千英里的不同地點命名。1967年初,在現(xiàn)在的剛果民主共和國工作的一組科學(xué)家和醫(yī)生報告了一種病毒的詳細(xì)信息,該病毒自20世紀(jì)50年代以來在該地區(qū)爆發(fā)了一種神秘的病毒性出血熱。1967年晚些時候,一個俄羅斯病毒學(xué)家發(fā)表了引起蜱傳出血熱癥狀的病毒的識別特征,該病毒已被自20世紀(jì)40年代以來,該病毒在克里米亞半島的蘇聯(lián)軍事人員中流傳.
經(jīng)過仔細(xì)檢查,這兩種病毒被認(rèn)為是相同的,從而產(chǎn)生了組合名稱克里米亞-剛果出血熱(CCHF)。A伊拉克大規(guī)模爆發(fā)該病毒感染2022年上半年造成212例克里米亞-剛果出血熱病例奪去了27人的生命。也有恐懼這種疾病可能會出現(xiàn)在新的地區(qū)由于氣候變化使得攜帶病毒的蜱蟲向北傳播到法國、意大利、西班牙和巴爾干等歐洲部分地區(qū)。
病毒首次發(fā)現(xiàn)時的名稱也可能具有誤導(dǎo)性。Mpox是一種會傳染給人類的動物疾病,被稱為人畜共患病。直到2022年,它才被稱為猴痘。WHO建議將其重新命名為Mpox試圖阻止伴隨舊名稱而來的種族主義和污名化。
該病毒之所以被命名為猴痘,是因為它是第一個出現(xiàn)的病毒。在從中非進口到歐洲的猴子中發(fā)現(xiàn)用于研究。然而,猴子是偶然的宿主——主要自然宿主是嚙齒類動物,包括非洲繩松鼠。
該病毒與天花屬于同一分類家族(正痘病毒),但并非所有名稱中帶有“pox”的病毒都是相關(guān)的。水痘病毒,更正式的名稱是水痘帶狀皰疹病毒,實際上是與引起唇皰疹和生殖器疣的病毒有關(guān),單純皰疹病毒。
如何診斷病毒
20世紀(jì)上半葉,顯微鏡技術(shù)取得了重大進步,增強了檢測和識別病毒的能力。大多數(shù)病毒都太小,無法在普通光學(xué)顯微鏡下發(fā)現(xiàn),無論其分辨率如何。但電子顯微鏡的出現(xiàn)讓許多重要病毒的檢測和表征。例如,乙型肝炎病毒就是這樣的:1970年被發(fā)現(xiàn)。
21世紀(jì)的病毒學(xué)擁有更多可用工具,包括病毒遺傳物質(zhì)的快速測序。強大的全基因組測序技術(shù)還允許科學(xué)家找到樣本中的所有遺傳物質(zhì),并在計算機的幫助下將其與已知病毒進行匹配。它還可以幫助識別未知的病毒序列,就像2019年武漢科學(xué)家識別出新型冠狀病毒Sars-CoV-2時所發(fā)生的那樣。
它也與雞無關(guān)。相反,這個俗名源于它引起的水泡看起來有點像鷹嘴豆(盡管其他理論認(rèn)為這是因為處于感染狀態(tài)的兒童看起來就像是被感染了一樣)被雞啄得遍體鱗傷)。病毒的正式名稱“水痘”來自拉丁語,意思是“斑點”(水痘時全身充滿液體和病毒的大麻點),“帶狀皰疹”的意思是“帶子”,指的是患有帶狀皰疹的人身上明顯的斑點帶。但在過去的40年里,這種正式的標(biāo)識不斷被完善,它的正式名稱也變成了聽起來有些奇怪的名字。人水痘病毒α3.
這突顯了病毒命名方法近年來發(fā)生了某種程度的轉(zhuǎn)變。
雖然以癥狀或地點命名病毒可能具有一種奇怪的浪漫吸引力,但作為病毒分類系統(tǒng),它缺乏病毒學(xué)家所需的邏輯和順序??茖W(xué)家需要了解生物學(xué)關(guān)系,以幫助他們設(shè)計診斷測試和開發(fā)抗病毒治療方法。它們可以幫助預(yù)測新出現(xiàn)的病毒的行為方式并協(xié)助疫苗開發(fā)。
它已導(dǎo)致國際病毒分類委員會的科學(xué)家–一個維護具有批準(zhǔn)名稱的病毒清單的機構(gòu)–尋找更好的方法從混亂中恢復(fù)秩序。
基因測序技術(shù)的進步意味著科學(xué)家們能夠更好地確定病毒之間是否存在相關(guān)性。例如,一些引起類似癥狀的病毒實際上可能是由截然不同的病毒引起的。如果我們再看看病毒性出血熱,它們可能是由四個不同的病毒家族引起的。
它們?nèi)绾谓M合在一起取決于它們的基因組成。您可能熟悉我們體內(nèi)發(fā)現(xiàn)的相互纏繞的DNA鏈——著名的雙螺旋——以及所有其他生物,從細(xì)菌到植物,再到動物。但在病毒世界中,事情變得更加復(fù)雜。有些病毒確實有這種雙鏈DNA,但其他病毒只能有一條。
許多病毒,包括那些引起嚴(yán)重疾病的病毒,例如病毒性出血熱、Covid-19和流感病毒,使用一種不同的遺傳物質(zhì),稱為RNA。有些攜帶兩條RNA鏈,而另一些則只攜帶單鏈。
這些高水平的遺傳差異對于理解病毒之間的關(guān)系非常有幫助,并且是分類系統(tǒng)的基礎(chǔ)由加州理工學(xué)院病毒學(xué)家設(shè)計并命名大衛(wèi)·巴爾的摩。在這個系統(tǒng)中,病毒根據(jù)其攜帶的遺傳物質(zhì)類型被分為七組之一。對于使用DNA作為基因組的病毒,情況非常簡單——I組是雙鏈DNA病毒,II組是單鏈DNA。第三組是雙鏈RNA病毒。
一些病毒具有單鏈RNA,可以直接劫持將遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)化為它們感染的細(xì)胞中的蛋白質(zhì)的細(xì)胞工具。這些病毒被稱為正義RNA病毒,屬于第四組。對于其他病毒,RNA代碼需要在細(xì)胞中進行額外處理才能翻譯,這些病毒被稱為負(fù)義RNA病毒,形成第五組。
在嘗試識別病毒時,病毒學(xué)家尋找差異而不是相似之處
為不屬于任何這些主要類別的棘手病毒創(chuàng)建了兩個附加類別。第六組包括RNA病毒,其中遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)化為DNA作為其生命周期的關(guān)鍵部分,例如人類免疫缺陷病毒(HIV)。VII組病毒使用雙鏈DNA,但其中一條鏈不完整,因此必須一路制備一段RNA——乙型肝炎病毒就是一個例子。
但這還不是結(jié)束。讓我們看一下兩種在感染者中產(chǎn)生類似癥狀的病毒。登革熱病毒是一種正義RNA病毒,就像基孔肯雅病毒一樣,但如果我們更詳細(xì)地觀察它們的遺傳密碼的細(xì)節(jié),很明顯它們的差異相當(dāng)大。
例如,當(dāng)試圖在患者樣本中識別病毒時,病毒學(xué)家會尋找差異而不是相似之處。所有單鏈正義RNA病毒組是有幫助的,但它太寬泛了。因此,另一個互補的分類系統(tǒng)使用的原理類似于為所有生物體分類而開發(fā)的方法,即以瑞典生物學(xué)家卡爾·林奈(CarlLinnaeus)命名的林奈方法。
ICTV就采用了這種分類方案。它將病毒分為領(lǐng)域、目和科。在這個體系下,登革熱病毒就在家中黃病毒科和屬黃病毒屬,以及黃熱病病毒。相比之下,基孔肯雅熱屬于披膜病毒科家庭和甲病毒屬與O'nyong'nyong并列的屬。
隨著新科學(xué)的出現(xiàn),ICTV的專家委員會審議和評估病毒的分組,并相應(yīng)地改變其分類法。ICTV還可以解決有關(guān)命名的爭議。一個很好的例子發(fā)生在20世紀(jì)80年代中期,當(dāng)時一種新病毒被確定為導(dǎo)致獲得性免疫缺陷綜合癥(艾滋?。┑脑?。參與分離和表征病毒的主要研究小組提出了兩個候選名稱:人類T細(xì)胞淋巴細(xì)胞病毒III(HTLV-III)和淋巴結(jié)病病毒(LAV)。但他們無法達成一致,也沒有人愿意妥協(xié),所以ICTV決定使用人類免疫缺陷病毒(艾滋病毒),從那時起就被普遍使用。
但他們的工作還沒有完成。下一代基因測序技術(shù)導(dǎo)致已知病毒的數(shù)量迅速增長。英國牛津大學(xué)病毒學(xué)教授、ICTV小組委員會主席彼得·西蒙茲(PeterSimmonds)表示,五年前,已知病毒約有800種。該小組委員會負(fù)責(zé)審議病毒的分類。ICTV目錄中現(xiàn)在列出的號碼是現(xiàn)在接近15,000.
大多數(shù)已知病毒并不知道會引起疾病,但那些確實會引起疾病的病毒,除了ICTV分類法分配的官方名稱外,往往還會被賦予可識別的名稱。西蒙茲說,ICTV的“作用在于它們的分類方式,盡管進行命名和分類的病毒學(xué)家之間存在一些重疊”。他指出,這是“ICTV研究小組提出了Sars-CoV-2這個名字“對于2019年的新型冠狀病毒。
Simmonds表示,隨著發(fā)現(xiàn)速度的加快,ICTV分類中需要分組的病毒數(shù)量可能很快就會接近100,000種。
該中心首席病毒學(xué)家延斯·庫恩(JensKuhn)表示,即便如此,這也可能是一個保守的估計。國家過敏和傳染病研究所(NIAID)位于馬里蘭州德特里克堡的綜合研究機構(gòu),以及埃博拉病毒專家。(另一個VHF),并且是負(fù)責(zé)審議病毒分組的ICTV小組委員會之一的主席。
當(dāng)所有物種都被重新命名時,很多病毒學(xué)家都非常驚訝——彼得·西蒙茲
“從科學(xué)的角度來看,病毒是美麗的,”他說。庫恩是另一個ICTV小組委員會的主席,其任務(wù)是了解目前發(fā)現(xiàn)的大量病毒。“隨著每一種新病毒的發(fā)現(xiàn),它變得越來越復(fù)雜。”
這導(dǎo)致ICTV最近審查了所有病毒的分類,以按屬和種來描述它們,就像在生物學(xué)的其余部分.
“當(dāng)所有物種都被重新命名時,許多病毒學(xué)家都非常驚訝,”西蒙茲說。
但庫恩表示,隨著科學(xué)家與世界各地同事的合作日益增多,這些官方名稱對于確保科學(xué)家能夠有效溝通非常重要。隨著研究人員共享數(shù)據(jù)并共同應(yīng)對Sars-CoV-2病毒構(gòu)成的全球威脅,Covid-19大流行帶來了前所未有的規(guī)模的國際科學(xué)合作。
“世界各地的物種名稱拼寫都相同,”庫恩說。“他們是拉丁化的并使用拉丁字母。”這意味著在正式場合中所指的是哪種病毒是毫無疑問的。
但他承認(rèn),作為人類,我們需要給事物貼上標(biāo)簽,而且名字需要容易記住。“我們通過語言多樣性來慶祝病毒多樣性,”他舉了埃博拉病毒的例子說。“聽起來很有趣,所以會引起共鳴。”ICTV官方名稱扎伊爾正埃博拉病毒不太可能激發(fā)想象力。
至于登革熱病毒?2022年,ICTV也對其進行了更名?,F(xiàn)在它的名字遠(yuǎn)沒有那么吸引人登革熱正黃病毒。當(dāng)然,更有條理,但這一口甚至可能讓西班牙女王的液體筆停下來。
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